涉嫌强奸罪的案件在检察院是否可以不起诉，需要根据具体案情来判断。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十七条的规定，人民检察院在审查刑事案件时，如果发现犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者存在法律规定的特定情形之一，应当作出不起诉决定。这意味着，在某些情况下，涉嫌强奸罪的犯罪嫌疑人在检察院也可以不起诉。

具体来说，如果检察机关经过调查后认为嫌疑人没有实施强奸的行为，或者嫌疑人的行为不符合强奸罪的构成要件，那么根据这一条款，检察院可能会决定不起诉。此外，如果强奸罪的情节较轻，且根据刑法规定不需要判处刑罚或可以免除刑罚，检察院也可能选择不起诉。

需要注意的是，不起诉并不意味着完全免责。即使检察机关决定不起诉，也可能是基于其他考虑，如社会危害性较小、被害人谅解等因素。在这种情况下，检察院可能会提出检察意见，将案件移送有关主管机关处理，给予行政处罚、处分或者没收违法所得等处理。

涉嫌强奸罪的案件在检察院是否可以不起诉，取决于具体案情和检察机关的调查结果。如果检察机关认为嫌疑人没有犯罪事实或者存在法律规定的特定情形之一，可以作出不起诉决定。如果强奸罪的情节较轻，且根据刑法规定不需要判处刑罚或可以免除刑罚，检察院也可能选择不起诉。

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相关法条1.《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十七条

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1.（2017）鄂09刑终22号:何文玩忽职守罪二审刑事裁定书

2.（2019）冀1121刑初172号:孟召泉、吴国振非法转让、倒卖土地使用权、聚众斗殴、骗取贷款、票据承兑、金融票证、诈骗一审刑事判决书

3.（2020）赣刑终201号:周澜松、江久松等组织、领导、参加黑社会性质组织罪、强迫卖淫罪、强奸罪、猥亵儿童罪、聚众斗殴罪、寻衅滋事罪、妨害信用卡管理罪、窝藏、包庇罪、寻衅滋事罪、妨害信用卡管理罪、协助组织卖淫罪刑事二审刑事判决书

4.（2019）新3024刑初115号:穆建军、李春等非法经营罪一审刑事判决书

5.（2019）甘10刑终163号:韩鹏祥、张双远等与李彦俊、朱恒发等抢劫罪二审刑事裁定书