根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条的规定，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。如果夫妻双方因感情不和分居满二年，且调解无效的，应当准予离婚。因此，如果夫妻双方因感情不和分居满二年，可以向人民法院提起离婚诉讼，申请离婚证明书。

在申请离婚证明书的过程中，需要提供多方面的证据证明夫妻双方已经分居满二年。这些证据包括但不限于：

书信或电子邮件：如果夫妻双方有来往的书信或电子邮件，其中的内容可以证明夫妻双方感情不好，属于分居状态，应当保存好这些内容作为证据。证人证言：夫妻双方身边的人，如共同认识的朋友或亲戚，可以作为证人证明夫妻双方的婚姻状态。需要注意的是，法律取证时不会全部采信证人的部分言语，因此需要多找几个证人来证明夫妻双方分居的状态。分居证明材料：如果夫妻双方已经分居，可以给对方发一份分居证明材料，写清楚夫妻双方现在的状态是分居。这些书面的分居文书最好是以邮政快递的方式寄送，这样可以保留寄送的凭证，在法律需要取证的时候，发件的时间就是夫妻双方开始分居的时间。

如果人民法院审理离婚案件后，确认夫妻双方因感情不和分居满二年，且调解无效的，应当准予离婚。完成离婚登记，或者离婚判决书、调解书生效，即解除婚姻关系。此时，夫妻双方可以获得离婚证明书。

LFA小编建议如果夫妻双方因感情不和分居满二年，可以向人民法院提起离婚诉讼，申请离婚证明书。在申请过程中，需要提供多方面的证据证明夫妻双方已经分居满二年。建议夫妻双方在分居期间保留好相关证据，并咨询LFA.CN认证律师的意见，以便更好地维护自己的合法权益。

相关法条1.《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条

2.《中华人民共和国民法典》第一千零八十条

相关案例根据您提供的信息，可基于[民事、离婚、感情确已破裂、家庭暴力、分居协议]作为检索关键词，据此，为您推荐以下案例供参考：

1.（2016）川0792民初897号:悓丽与王春舜离婚纠纷一案民事一审判决书

2.（2014）调民三初字第00441号:侬某某诉王某某离婚纠纷的民事判决书

3.（2014）内中民初字第379号:张某甲与罗某离婚纠纷一审判决书

4.（2016）湘0405民初675号:原告刘某诉被告王某某离婚纠纷一审判决书

5.（2014）龙民初字第5484号:甘某甲与甘某乙离婚纠纷一审民事判决书